Ну ясно, ваше мнение о 3 сезоне вцелом?

Ну что можно сказать? Это последний сезон, в котором Шреддер (Ч'релл) был основным врагом ЧН. А в общем этот сезон насыщен разными тяжёлыми событиями: Трицератоны и Федерация вновь начали охотиться на Фуджитоида (началось это ещё во 2-м сезоне), и в связи с этим захватили Землю под свой контроль, но в результате, когда выяснилось, что все данные относительно телепорта стёрты из памяти Фуджитоида, то между ними настало перемирие, а их правители (Занрамон и генерал Бланк) были свергнуты, что вполне радует; кроме того, в этом сезоне впервые был представлен агент Бишоп, который тоже показал себя не с лучшей стороны, мало того, он к тому моменты был очень большим долгожителем благодаря инопланетным технологиям (известен он с 1815 года!), и благодаря им же, обладал неимоверной силой (как он отделал Хана в серии "Хан в бегах"!), что также меня порадовало; также в этом сезоне вновь появились Драко и сын Даймио, ставшие одним существом после того, как их затянуло в портал в конце предыдущего сезона (хотя как это возможно - непонятно), и раскидавшие Черепашек-ниндзя во времени (интересно было взглянуть на альтернативное будущее), но потом они в результате были уничтожены, хотя один из них (а именно - сын Даймио) был возрождён, и не просто, а превращён в ребёнка, то есть, ему фактически была дана вторая жизнь (честно говоря, мне это не очень понравилось, лучше бы сделали его взрослым, как и прежде); ну и наконец, как уже было отмечено выше, Шреддер-утром в конце этого сезона был побеждён и сослан на ледяной астероид. Да, в этом мультсериале Шреддер оказался не таким долгоиграющим, как в предыдущем 1987 г., честно говоря, даже немножко обидно.
Ставлю этому сезону 4, поскольку мне кажется, что следующий 4-й сезон немного круче!

Согласно блогу Питера Лерда, порядок серий:
53 «The Christmas Aliens»
54–56 «Space Invaders»
57-59 «Worlds Collide»
60 «Touch and Go»
61 «Hunted»
62 «H.A.T.E.»
63 «Nobody's Fool»
64 «New Blood»
65 «The Lesson»
66 «The Darkness Within»
67 «Mission of Gravity»
68 «The Entity Below»
69 «Time Travails»
70 «Hun on the Run»
71 «Reality Check»
72 «Across the Universe»
73 «Same As It Never Was»
74-75 «The Real World»
76 «Bishop's Gambit»
77-78 «Exodus»

Насчет 53 «The Christmas Aliens», скорей всего он первый по счету, хоть в блоге и не сказано точно, но он планировался ещё когда работали в средине 2 сезона, и 54-56 несколько раз именовались как «Space Invaders».
Что интересно, Лерд не сказал ни слова о 70 «Hun on the Run», может случайно пропусстил. Логичнее будет поменять местами 69 и 70 с точки зрения сюжета.